Tokat, coğrafi konumu ve sahip olduğu iklim özellikleri açısından barındırdığı ekolojik çeşitlik ile ülkemizdeki beş mikrogen merkezinden biridir. Tokat ilinde yetiştirilen meyve cins ve türleri, fasulye, mercimek, bakla, baklagil yem bitkileri türleri ile bu merkezler arasındadır. Ülkemizde ayrıca bitkisel biyoçeşirliliğinin korunması açısından Tarımsal Araştırmalar ve Politikalar Genel Müdürlüğüne bağlı 18 Araştırma Enstitüsü’nde arazi gen bankası bulunmaktadır. Tokat ilinde bulunan Orta Karadeniz Tarımsal Araştırma Enstitüsü asma, elma, kiraz, erik ve armut meyve genetik kaynaklarının muhafazasından sorumlu araştırma kuruluşudur.
Tokat ili flora özellikleri itibariyle birçok tıbbi ve aromatik bitkiyi barındırmaktadır. Yapılan akademik çalışmalarda Tokat ilinde 42 çeşit tıbbi aromatik bitkinin ekonomik açıdan önem taşıdığı tespit edilmiştir.
40 çeşit tıbbi aromatik bitki içerisinde 14 bitki türü 41.776 da üzerinde bir alanda yetişmektedir.
İl genelinde en fazla alanı 1 256 da ile Dağ Kekiği türünün kapladığı görülmüştür. Yayla Kekiği, Yarpuz-Nane, Tıbbi Nane, Kuşburnu, Eşek Nanesi, Sarımsak, Çemen, Melissa-Oğulotu, Aynısafa, Sarı Kantaron, Alman Papatyası, Çörekotu ve Defne türleri bu 14 bitki arasındadır. Belirlenen bitki türlerinin kapladığı toplam alan yönünden Erbaa (7 197.8 da), Almus (7 118.6 da), Niksar (6 901.5 da), Reşadiye (5 416.3 da) ve Merkez (4 278.3 da) ilçeleri ön plana çıkmaktadır. Bu ilçeleri sırasıyla Zile (3 576.1 da), Turhal (2 630.9 da), Artova (1 616.3 da), Pazar (1 192.6 da), Sulusaray (832 3 da), Yeşilyurt (691 9 da), Başçiftlik (323 8 da) izlemektedir.
Bitki tür sayısı (zenginliği) yönünden Erbaa, Almus, Niksar ve Reşadiye ilçeleri (14 tür) öne çıkmaktadır. Başka bir deyişle belirlenen 14 bitki türünün hepsi bu ilçelerde mevcuttur. Bu ilçeleri sırasıyla Merkez (13 tür), Turhal (13 tür), Pazar (11 tür), Zile (10 tür), Artova (6 tür), Sulusaray (6 tür), Başçiftlik (6 tür) ve Yeşilyurt (4 tür) izlemektedir.
Hem toplam alan hem de tür zenginliği yönünden ön plana çıkan Erbaa, Almus, Niksar ve Reşadiye ilçeleri aynı zamanda bitki biyolojik çeşitliliğinin yüksek olduğu Aşağı Kelkit Havzası olarak bilinen coğrafik lokasyonda yer almaktadır.
